Author: haoransun
Wechat: SHR—97
Dpabi工具提取信号之后在目标目录生成7个文件
- ROI_OrderKey_ROISignal_7.tsv
- ROICorrelation_FisherZ_ROISignal_7.mat
- ROICorrelation_FisherZ_ROISignal_7.txt
- ROICorrelation_ROISignal_7.mat
- ROICorrelation_ROISignal_7.txt
- ROISignals_ROISignal_7.mat
- ROISignals_ROISignal_7.txt ROISignals开头的(130*2个文件)就是需要的fmri时间序列文件,
共包含txt和mat两种格式,两种格式文件所存内容一致,只是文件格式不一样。
ROI_OrderKey_ROISignal_7.tsv
脑区模板定义文件
ROISignals_ROISignal_7
- ROISignals_ROISignal_7.mat
- ROISignals_ROISignal_7.txt
TR如果是140(未去除前N个可能会导致误差的扫描),ROI定义为116
矩阵为140(TR数)x116(ROI数),是该被试的time course
ROICorrelation_ROISignal_7
- ROICorrelation_ROISignal_7.mat
- ROICorrelation_ROISignal_7.txt
一般是116x116矩阵,为116个ROI之间的correlation
ROICorrelation_FisherZ_ROISignal_7
- ROICorrelation_FisherZ_ROISignal_7.mat
- ROICorrelation_FisherZ_ROISignal_7.txt
一般是116x116矩阵,为116个ROI之间的correlation,但已经过z转换
https://blog.csdn.net/qq_41576771/article/details/120937467
如何将AAL的116个脑区转为90个?
- 确定小脑内parcellation unit的编号
- 将那些值为上面那些编号的vocel找出来,将其置为0.
文件具体分析
http://www.360doc.com/content/20/1013/17/71929693_940267401.shtml
https://cloud.tencent.com/developer/column/2030?tag=10802
https://cloud.tencent.com/developer/column/2030
信号文件(基于种子的FC提取)
ROISignals_ROISignal_7
140*116,140为时间序列,116为事先定义好的脑区
ROICorrelation_ROISignal_7
116*116,由上述原始脑信号经过皮尔逊相关系数计算得到的FC-Matrix,值在-1~1之间
ROICorrelation_FisherZ_ROISignal_7
通过Fisher-Z变换将皮尔逊相关系数的分布由原来的-1~1的偏态转换成正负无穷的正态分布以符合假设检验的前提假说。
每个被试包含了7个文件,其中“ROI_OrderKey_SubXXX.tsv”存储了SubXXX被试所有的ROI编号以及ROI文件路径信息。
ROICorrelation_Sub001.mat/ROICorrelation_FisherZ_Sub001.mat/ROICorrelation_Sub001.txt/ROICorrelation_FisherZ_Sub001.txt:存储了一个N*N的矩阵(N代表预定义的种子点数目),其中第i行与第j列存放了编号分别为i和j的种子点之间的功能连接。“FisherZ”代表这些功能连接的数值经过了Fisher’s Z转换,更加服从正态分布。
ROISignals_Sub001.mat/ROISignals_Sub001.txt:存储了一个P*N的矩阵。P代表了时间点数目,N代表了预定义的种子点数目。矩阵的第i列表示编号为i的种子点的平均时间序列。